1、农产品加工企业需要缴纳的税种主要有：1，增值税，税率17%。如果加工后的产品仍然属于初级农产品，税率11%。如果是小规模纳税人，征收率3%。2，附加税费，是以实际缴纳的增值税额和消费税额为计税依据征收的，包括：（1）城市建设维护税，不同地域的税率为：城市，7%；县城镇，5%；乡村1%。
2、公司收购农产品销售〈直接或加工后〉要交增值税，小规模纳税人3%，—般纳税人13%〈不在规定农产品范围内，有可能17%），选择—般纳税人纳税为好，收购农户的农产品依买价抵扣13%的进项税，造成公司税负很低或为零.2，农产品加工企业免征戓减半征征企业所得税（不在规定农产品范围内要交企业所得税）。
3、牲畜、家禽的饲养：企业可以享受减半征收企业所得税的优惠。 林产品的采集：企业可以享受减半征收企业所得税的优惠。 灌溉、农产品初加工、兽医、农技推广、农机作业和维修等农、林、牧、渔服务业项目：企业可以享受减半征收企业所得税的优惠。
4、．灌溉、农产品初加工、兽医、农技推广、农机作业和维修等农、林、牧、渔服务业项目；8．远洋捕捞。企业从事下列项目的所得，减半征收企业所得税：1．花卉、茶以及其他饮料作物和香料作物的种植；（包括“观赏性作物的种植”）2．海水养殖、内陆养殖。（《国民经济行业分类》内陆养殖属于渔业。
5、农产品加工企业在购进农业生产者销售的自产农产品时_可以按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和13%的扣除率计算进项税额。而农产品加工企业在购进一般纳税人销售的非自产农产品时_可将取得的增值税专用发票上列示的税额作为进项税额进行抵扣。
1、首先需要到税务机关进行企业所得税优惠备案，然后，然后就是正常核算，申报了。
2、正面回答农产品加工企业购进农产品的增值税抵扣政策。农产品加工企业在购进农业生产者销售的自产农产品时_可以按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和13%的扣除率计算进项税额。
3、直接免征的增值税的企业也是要缴纳企业所得税的，如果企业所得税的应纳所得额不超过100万元，减按25%计入应纳税所得额，按20%的税率缴纳企业所得税；对年应纳税所得额超过100万元但不超过300万元的部分，减按50%计入应纳税所得额，按20%的税率缴纳企业所得税。
4、农产品加工企业购进农产品，可凭增值税发票、海关进出口增值税专用缴款书、农产品收购发票或销售发票抵扣进项税额。下一步，将继续支持地方扩大农产品加工企业进项税额核定扣除试点行业范围，完善农产品初加工所得税优惠目录，落实税收优惠政策。
5、其所收取的加工费，可以按照农产品初加工的免税项目处理。若从事项目符合实施条例第八十六条规定农、林、牧、渔业项目，且是免征企业所得税种子企业委托的，可参照“企业受托从事实施条例第八十六条规定农、林、牧、渔业项目取得的收入，比照委托方享受相应的税收优惠政策。”免征企业所得税。
6、对一般纳税人而言，农产品必须是其经营范围 可以向主管税局申请领购农产品收购发票，自行开具，然后按收购金额的13%计算抵扣进项税额。取得销货方开具的农产品销售普通发票，也可以按价税合计的13%计算抵扣进项税额。
1、农产品初加工依法享受国家税收减免政策，根据《享受企业所得税优惠政策的农产品初加工范围（试行）》《关于享受企业所得税优惠的农产品初加工范围的补充通知》。法律依据《享受企业所得税优惠政策的农产品初加工范围（试行）》种植业类 （一）粮食初加工 小麦初加工。
2、初加工属于第一道加工农产品优惠政策免企业所得税 。《企业所得税法实施条例》第八十六条进一步规定，企业从事农产品初加工的所得，免征企业所得税。
3、首先需要到税务机关进行企业所得税优惠备案，然后，然后就是正常核算，申报了。
4、企业同时从事适用不同企业所得税待遇的项目的，其优惠项目应当单独计算所得，并合理分摊企业的期间费用；没有单独计算的，不得享受企业所得税优惠。因此，农产品初加工企业取得政府补助收入和其他项目收入，应当单独计算农产品初加工所得，并合理分摊企业的期间费用；没有单独计算的，不得享受企业所得税优惠。
5、另外，以下项目的所得减半征收企业所得税：花卉、茶以及其他饮料作物和香料作物的种植；海水养殖、内陆养殖。这些税收优惠政策旨在支持和鼓励农产品初加工业的发展，为农民和企业提供更多的税收减免，促进农产品的流通和增值。